TABLE 1.

Primers used for generation of probesa

LocusPrimer
194.m00115 F5′-ATGGGCAATAGACCCAACAC-3′
194.m00115 R5′-TCCATAAATTTTTGCATGACCA-3′
2.m00567 F5′-ATGAACGCTATTAAACCTAAAACAAT-3′
2.m00567 R5′-CTATTATTTGTCTGAATTGTCTAAAGCTG-3′
2.m00567 putative promoter region F5′-AAAAGCCATTGAAAATGGATG-3′
2.m00567 putative promoter region R5′-TCCATCAACATCCAATACAATTG-3′
238.m00054 segment #1 F5′-ATGGCTGAACAAATCAGAGTCTGACA-3′
238.m00054 segment #1 R5′-CTAAAGTAATAATGCTGGAACATTTGGATGG-3′
238.m00054 segment #2 F5′-GAATCACCGAATGTTATTGCATCTGG-3′
238.m00054 segment #2 R5′-CTACTGTGAATCTTTAACACGGATGTTCGA-3′
238.m00054 segment #3 F5′-TCGAACATCCGTGTTAAAGATTCACAG-3′
238.m00054 segment #3 R5′-CTACATTGTCTTTCCTCCAATTTCATCTCC-3′
29.m00210 F5′-ATGCAACAAGAGACAGTTGTTGG-3′
29.m00210 R5′-CTATTATTTTTGTGCAAAGAATTTCTCT-3′
29.m00231 F5′-CCCCTTCATCGACAAACAAT-3′
29.m00231 R5′-TCGATGACGTCTTGATTTGG-3′
297.m00063 F5′-TCAGCATGGATTTGATTGGA-3′
297.m00063 R5′-CAGCAACACCTTTTTCAACG-3′
5.m00482 F5′-TCTGGTGCTTTTGATGTTGC-3′
5.m00482 R5′-CCACCGAAGGATCACACTCT-3′
51.m00161 F5′-GTCAAAGAGCTGTTGCATGG-3′
51.m00161 R5′-TTCTGCAACATTTCCTGGTG-3′
6.m00454 F5′-GATTCTTCATTTGCCGTGCT-3′
6.m00454 R5′-CCGAATGAAGCCCAATTATC-3′
6.m00467 F5′-AATGGGCACAACCTATTGCT-3′
6.m00467 R5′-TTTCCCCATTCAAAGCATGT-3′
9.m00419 F5′-AACCACCAAAAATTCCACCA-3′
9.m00419 R5′-AATTGGTGAACGGGCAGTAG-3′
EhActin F5′-GCTGGTATGGGTCAAAAGGA-3′
EhActin R5′-TTTCTGTGGACAATAGCTGGTC-3′
EhLINE1 ORF1 F5′-GATCCTTTTCCAATGCAGGA-3′
EhLINE1 ORF1 R5′-TGCTTTTCTCTTCGATTTCCA-3′
EhLINE1 ORF2 F5′-TGAARATAGGGATTACTTCMGTGT-3′
EhLINE1 ORF2 R5′-CCCATTAGACATGGTAAGTGGAA-3′
M13 F5′-TGTAAAACGACGGCCAGT-3′
M13 R5′-CAGGAAACAGCTATGACC-3′
  • a Probes were used for Northern blot analyses and sequencing particular loci in E. histolytica Rahman. Tm values ranged between 56 and 58°C.