TABLE 2.

S. pneumoniae sequence types by isolate source

Isolate sourceNo. of isolates (no. of STs)ST(s) (no. of isolates)
Blood82 (50)a199 (8), 220 (5), 376 (4), 433 (4), 81 (3), 113 (3), 393 (3), 13 (2), 37 (2), 62 (2), 191 (2), 227 (2), 632 (2), 659 (2), 1073 (2), 1390 (2), 36 (1), 43 (1), 66 (1), 72 (1), 124 (1), 132 (1), 156 (1), 176 (1), 180 (1), 193 (1), 218 (1), 244 (1), 251 (1), 385 (1), 425 (1), 452 (1), 498 (1), 558 (1), 636 (1), 638 (1), 641 (1), 643 (1), 678 (1), 690 (1), 899 (1), 1092 (1), 1269 (1), 1397 (1), 1402 (1), 1514 (1), 1516 (1), 1521 (1), 1522 (1), 1535 (1)
CSF57 (36)13 (7), 37 (3), 113 (3), 124 (2), 138 (2), 156 (2), 191 (2), 376 (2), 473 (2), 1212 (2), 1389 (2), 1391 (2), 1512 (2), 1524 (2), 146 (1), 15 (1), 81 (1), 90 (1), 166 (1), 305 (1), 355 (1), 460 (1), 547 (1), 643 (1), 689 (1), 867 (1), 1060 (1), 1073 (1), 1390 (1), 1392 (1), 1393 (1), 1394 (1), 1515 (1), 1536 (1), 1537 (1), 1892 (1)
Middle ear100 (59)236 (9), 13 (7), 81 (7), 180 (6), 271 (4), 156 (4), 62 (3), 199 (3), 460 (3), 67 (2), 83 (2), 90 (2), 376 (2), 37 (1), 113 (1), 124 (1), 125 (1), 138 (1), 146 (1), 153 (1), 177 (1), 191 (1), 193 (1), 246 (1), 274 (1), 384 (1), 425 (1), 558 (1), 629 (1), 639 (1), 671 (1), 802 (1), 1060 (1), 1119 (1), 1165 (1), 1177 (1), 1258 (1), 1396 (1), 1398 (1), 1508 (1), 1509 (1), 1510 (1), 1511 (1), 1513 (1), 1517 (1), 1518 (1), 1519 (1), 1520 (1), 1521 (1), 1523 (1), 1528 (1), 1529 (1), 1530 (1), 1531 (1), 1532 (1), 1533 (1), 1534 (1), 1890 (1), 1891 (1)
Carriage103 (56)558 (7), 473 (6), 37 (5), 199 (5), 460 (5), 1092 (5), 180 (4), 568 (4), 81 (3), 315 (3), 1843 (3), 62 (2), 66 (2), 236 (2), 257 (2), 385 (2), 439 (2), 1073 (2), 1839 (2), 13 (1), 33 (1), 65 (1), 90 (1), 113 (1), 147 (1), 156 (1), 251 (1), 320 (1), 376 (1), 384 (1), 496 (1), 626 (1), 643 (1), 651 (1), 656 (1), 816 (1), 1186 (1), 1190 (1), 1379 (1), 1388 (1), 1395 (1), 1448 (1), 1459 (1), 1538 (1), 1539 (1), 1757 (1), 1837 (1), 1838 (1), 1840 (1), 1841 (1), 1842 (1), 1844 (1), 1845 (1), 1846 (1), 1847 (1), 1889 (1)
  • a A total of 149 STs were identified in these studies. These numbers do not add up to 149 because several STs appeared among isolates from multiple sources.