TABLE 2.

PCR primers used in this study

Primer nameSequence (5′-3′)Target
1498-upATGCTGGCCGGAATATATCTCBPSS1498
1498-dnGCCATTCGTCCAGTTTGCGGBPSS1498
0518-upATGGCAAATGCTTTGGTTGABPSS0518
0518-dnGATCGGCGCGTTCTGCTTCABPSS0518
2098-upATGGGCGTCGCAATGTTTATGBPSS2098
2098-dnCATCTCGGTGTTCTCCTTGATGBPSS2098
0171-upATGGCGCAGGATATTTTTCTGBPSS0171
0171-dnGGCTTCCTTGTTGCCCTTGATGBPSS0171
0099-upATGTCGCACGACATTTTCCTCBPSS0099
0099-dnCGCCGCGTTCTTCTTGATGTCBPSS0099
3105-upATGTTACACATGCATTTGAAGBPSS3105
3105-dnGACCGCGTAGGTCTTGTCGTTCBPSS3105
BPSS1498-1GCTAGCATCCGCCAGTACGTCGTCGACBPSS1497
BPSS1498-2GGATCCTTTAAATCTAGACGGCGACGATCTGTCCATTTCBPSS1498
BPSS1498-3TCTAGATTTAAAGGATCCCCGCACAAAGACGATAGCAACBPSS1498
BPSS1498-4GCTAGCTCAGGAAATCGTTCGGATATCBPSS1499
BPSS0518-1GCTAGCATCTTCGCGACCTGCCGTTTCBPSS0517
BPSS0518-2GGATCCTTTAAATCTAGACTGCCAGCTCTGGATCTGGATBPSS0518
BPSS0518-3TCTAGATTTAAAGGATCCACGGATCAGATCCGCATCAACBPSS0518
BPSS0518-4GCTAGCATAACCACTCAGATAGTCGAGBPSS0519
BPSS2098-1GCTAGCCTCGCGAAGAACGGCTTCATGBPSS2099
BPSS2098-2GGATCCTTTAAATCTAGAGAACGACTGGATGTCGGTCCABPSS2098
BPSS2098-3TCTAGATTTAAAGGATCCCAGATCGAGTTCATGCGCGTGBPSS2098
BPSS2098-4GCTAGCCTCGAACATCAGCACGTTGTGBPSS2097
BPSS0171-1GCTAGCGCCGAATACGACGATTCCGACBPSS0172
BPSS0171-2GGATCCTTTAAATCTAGAGTGCATCGTCGATTCCTGCTGBPSS0171
BPSS0171-3TCTAGATTTAAAGGATCCGTCACGACGAGCTTCGACATCBPSS0171
BPSS0171-4GCTAGCCATTTTCCGGGTTCGGTGATCBPSS0170
BPSS0099-1GCTAGCCATCGAAAGAACACCGACTACBPSS0098
BPSS0099-2GGATCCTTTAAATCTAGAGACCTCGATTTCGCCCTTGTGBPSS0099
BPSS0099-3TCTAGATTTAAAGGATCCCCGCTCGAATACATCAAGCTCBPSS0099
BPSS0099-4GCTAGCTTTCAGCTCGTACAGCCGCACBPSS0100
BPSL3105-1GCTAGCCACTGCAAGAATTCCGATTACBPSL3106
BPSL3105-2GGATCCTTTAAATCTAGACGGCTGAACGATCGAGTGATCBPSL3105
BPSL3105-3TCTAGATTTAAAGGATCCGAGATCAAGCTGAAGTACGTGBPSL3105
BPSL3105-4GCTAGCGACTGCTCGTTCAGCTCGAACBPSL3104
amrR-1GCTAGCTCGGACAGGTCGAAGCCTTCamrR
amrB-1GCTAGCACGATTTTCAGGCGGTTCTGamrB
VgrG1-5′GATATCCAGGAGTTCCCGATGCCTTCBPSS1503
VgrG1-3′GATATCTCAGCCGAGCTGGATCAGTTGBPSS1503
1503-up2GGATCCTCGTCGCACCGCAGCGTCGTCBPSS1503
1503-dn2GGATCCTCAGCCGAGCTGGATCAGTTGGCCBPSS1503