Table 2

Oligonucleotide primers used in PCRs

LocusProteinPrimerDirectionaSequence (5′-3′)
sag1283Ssp-51330FCAATACCGAGGGATTAAAGCAG
1329RTAGCTGCTTCATCTGGCAATAA
sag0433Rib1321FTCCACGTACAGATGCCGATA
1322RTGGAGTTGCATTCTCACCTG
sag0823GapN1309FGGAATGCGTCCAATTATGCT
1310RGCGTTGTCCGGAGTAATCAT
sag1197HylB1351FGGAACGACGTGACTATTGGTAA
1352RTCCAGTTTGATAGCTTCGATGT
sag1768GAPDH1334FACCACGATATCCTTGATGGAAC
1333RCACCAGTGTATGCGTGGATAGT
sag1790DltA1318FTGACAGTTGCTCAACCAAGC
1317RAACATTTGCGGTCTTTCAGG
sag0832FbsB1363FCGGCGTATAAATCAACAGTCAA
1364RTTCAATAGCTTGGTAAGCACGA
sag1052FbsA1313FATTTTCATTGCGTCTCAAACC
1314RATTACCTAAAACAGGTGATGATCAAA
sag1127Fib1327FAACGTTCAATACAGCAACATCG
1328RATTTGTTTGGACCGTCTTTAGG
sag2053CspA1335FATACGATGAGGAACGAGCAAAT
1336RCAACGAGTAAGGCTGCTTTCTT
sag1190PavA1331FTCCTTCCTGGTTCGACTTACAT
1332RAGGGCTTAGATCATTGGTTTGA
sag1236ScpB955FCTGAAACTGCTACGGTCA
845RACGTTCAATAAGGGCAATC
sag2063BibA985FAGAGCATCACAGGATACA
984RACGTCTTGACTGCTTACC
sag1233Lmb1324FTATGACGCGGATTTGTTTGT
1323RCAATGCCTTGTGTGACTTCC
sag1463 (sal1543)RgA1368FCTTTACAGGCAATGGTCGTG
1367RTGCAGCTGGACCAATAATGT
sag1490RovS1326FTTAGCAGATGAGCACCTATCCA
1325RAGTGTGCGCCTTAGAATGAATC
sag1792DltR1320FTGCGGCTTGGAAATATAAGG
1319RCTGCTTTGCATTTCGCATAA
sag1957RgfA1344FGCGTTACAGCCAGGTACAATTA
1343RAAGTGGCTGTGAATTCCATTCT
sag1958RgfB1341FTGAAGAGCTGGTGTACCTTCAA
1342RTAGCAGAGCATATCTTCCGTGA
sag1959RgfC1346FAGTGTCACTCCAGCACGTTTTA
1345RGTGTCACCCAAACAAAGTTGAA
sag1462Srr11316FCAATGTCAGCCAGCACAAGT
1315RCTTGCTGATGTCGATGCACT
sag10071312FAAAGGAGTTGCTGAGCGTGT
1311RACCAAAACGACCAGAAGGTG
sag1466GlnP1353FTTGCTGCTACTATCGCTCTTTC
1354RCTACGACTTGCTTCCATTTGAC
sag1467GlnQ1389FGCATGGGATGGAATTACTTG
1390RCGCTAAGCTTCTTGCGATAG
sag07651307FCCGAAGGGATGTATGCAGTT
1308RGTCGCACCTTTCACAACAGA
sag1331Sar51340FGCAACTTTAGCAGCAACATCAC
1339RCGAACACTGTCAGCATATGGAT
sag13501304FCTCAACCACAAGCCCGTATT
1303RCTTGCCCTCCTTGTTCAGTC
sag09711305FTCTTGTTTCCGTTGCTGAGA
1306RTCGTTAACTGCATCGTTTGG
  • a F, forward; R, reverse.