Table 1.

Primers used for RT-PCR assays targeting C. pneumoniae mRNA

GenePrimer
adt1 5′-GCCGATACATACTCACGAGCTAAAGAAAG-3′ (outer)
5′-GCGAGGATCGGTCAATACGTTCTTA-3′ (outer)
5′-GACTGTAATTTATCCGCTACGCGATGTT-3′ (inner)
5′-GCGAGGATCGGTCAATACGTTCTTA-3′ (inner)
dnaA 5′-GACCTCTGTTCTTTTGTCCCCTTAGATG-3′ (outer)
5′-GATCTTTAGAGCGTGAGTTTCCCTTA-2′ (outer)
5′-GCCGCTCCTACAACCCTTTATTCATCC-3′ (inner)
5′-TCCTTTTTGCTCCGCCTTGTGCTGT-3′ (inner)
polA 5′-GCTGAGCACTGGACAAATGGGGGAGG-3′ (outer)
5′-GAGGGGTGTATTCTCTGTGTATGG-3′ (outer)
5′-GGGGAAATGCAGGATTGCCTATAGGTC-3′ (inner)
5′-CACTACGTAAAGCCTCTAACACCTCTGCAC-3′ (inner)
mutS 5′-CACTTTGCTATCCTCCACCCTGCTCCA-3′ (outer)
5′-CTGAGTGTCCCGATATCTCTAGGCCCTGC-3′ (outer)
5′-CGTATCGGGTCTCTGTTTGGTTTTGCTTG-3′ (inner)
5′-GAGGATCATTCAAGGGAGCGAGGAGC-3′ (inner)
ftsK 5′-TGGCTAGAGCTGTAGGGATTCATCTGA-3′ (outer)
5′-TAAACTAGCTGCTGCGGCATAACCAA-3′ (outer)
5′-CTATACGAGCTCAGGGTGCCTACATTTG-3′ (inner)
5′-TAAACTAGCTGCTGCGGCATAACCAA-3′ (inner)
ftsW 5′-AGCTCTCATCCGCCAGGTGACCTATC-3′ (outer)
5′-CGAACTCCTCAGCGTAGATTGCGGCA-3′ (outer)
5′-AGACGTTGGTTGGGGTTCGGTCAGC-3′ (inner)
5′-CAGGATGAAGGTAGACGTTTAAGCGG-3′ (inner)